本书中组织总的设定介绍：
A
本书中的组织分黑的和白的，白的自然是合法的企业，黑的自然是地下势力，也就是黑衣组织。
B
本书中的黑衣组织不是原作那种随便什么人都能加入的，原作中诸星大、水无怜奈、安室透等都成为组织的有封号成员，个人认为，这样的组织，如果不龟缩起来，早就被顺藤摸瓜打掉了很多触角，就是放长线，也不能容忍组织杀人。
C
本书中的黑衣组织是黑暗的，加入条件很简单，但很残忍，就是杀人，杀掉无辜的一家人，从此就投身于黑暗再也不能回头了，组织再也不怕你会背叛，因为就算作为污点证人，官方也无法放过你，仍然要去坐牢，只不过从死刑无期变成几十年的有期。这个条件在书还没有明说。
……
黑衣组织目前的人手：
A组
琴酒、伏特加，还有基安蒂、科恩。
这四人在本书中的变化是杀人不犹豫，不像原作中，废话一大堆，然后再动手。
他们就不在这里叙述了。
B组
贝尔摩德及其手下
本书中的贝尔摩德是真正的千面魔女，从来不露出真面目真声音，布局精妙，杀人如麻。
如果说琴酒是战术级的，那贝尔摩德就是战略级的，两人开战，狭路相逢是琴酒胜，不然就是贝尔摩德胜。
因为琴酒掌管的基地暴露，琴酒的敛财能力不足，所以贝尔摩德来了，没有直接任务的时候，在地下世界扩张的布局计划都是她在做，琴酒帮忙执行，而上面下达任务一般由琴酒带队。
本书中大明星莎隆和她女儿克丽丝也都在活动，一个出入顶层社会，一个作为迪斯尼驻岛国顾问，掌握温亚德基金，每年一半收益用于慈善。
个人认为，因为贝尔摩德而放弃大明星莎隆，那是本末倒置，而且可以找人做替身。
本书组织不是琴酒佣兵小队，而是庞大到可怕的神秘组织，其可怕的一角就是体现在大明星莎隆身上，当然，大明星莎隆是贝尔摩德这点在书中没有直接点出，只是柯南曾经因为偶然听到贝尔摩德的真声而怀疑过。
当明星就是接近明星出生的里根总统，而个人认为凭贝尔摩德的本事，加上组织财力的支持，可以把大明星莎隆送上王座，所以本书中的大明星莎隆在里根总统时代，就是里根总统的坐上客，里根夫人的闺蜜，现在仍然是世界政要的座上宾，世人眼中的慈善家，粉丝无数。
本书中的贝尔摩德凭借着她的化装能力，非常活跃，从剧场版1就在暗中活动。
其活着的有名部下为：
01外务省，吉冈昌仁，政界合作伙伴。
来自动画第230集神秘的乘客，本书是第06卷，第0878章登场，作用参考第09卷，第1328章。
02原佳明，计算机和生物遗传科学方面的专家。来自剧场5，本书是第06卷，第0927章前后。
其死了的有名部下为：
01清水丽子，培养的交际花，吸公司的血，玩崩了，被抹杀。
来自剧场10，本书是第11卷，第1729章开始。
02国会议员桝田大藏先生，被抓住把柄受控制的傀儡，死于自杀。
来自动画第478集真实的30分钟，本书是第12卷，第1917章登场。
动画第489集法庭对决，第1996章的事件中死亡。
C组
卡尔瓦多斯
本书中的卡尔瓦多斯还活着，活跃于依拉克，顺了一个集装箱武器运回岛国。本书第08卷1322章等，冲绳的爆炸事件，这个武器爆炸事件是真实发生的，在书中扩大了。
卡尔瓦多斯现在是一个有官方记录的正规雇佣兵，在贝尔摩德的财力支持下，手下有一个合法的民间军事组织。
D组
楠田陆道，与最初的沼渊己一郎类似的低级别杀手。
本书在第08卷第1325章事件中登场，对应动画第340集洗手间里的秘密。
楠田陆道住在宫野家附近，长期监视宫野家。
黑衣组织死去的成员
A
本书第01卷0205章，雪莉的三个手下因为体征泄露给石峰保全警备会社，并暴露了基地，琴酒当着雪莉的面，毫不留情的杀了他们，由此激发了雪莉怨恨石峰保全警备会社，也让雪莉走上了脱离组织的路。
在动画中，雪莉带人去工藤家，本书就安排了这三个人。
B
龙舌兰
动画第054集电玩公司事件，本书第02卷0375章等，游戏展事件。
本书中的龙舌兰是皮斯可那边的人，死于琴酒的局，是琴酒故意安置爆炸物杀他，为的是剪除皮斯可的人手。
B
沼渊己一郎
动画第118集浪花连续事件，本书第03卷0595章等，大阪沼渊今一郎事件，以及第03卷0603章等，乡司宗太郎议员吞枪自杀事件。
动画第124集神秘狙击者事件，本书第03卷0612章等，西多摩山区别墅议员内讧全死事件。
动画第289集，迷失森林的光彦，本书第07卷1153章等，沼渊今一郎死亡事件。
本书中，他是组织的后备队员，完成了训练，但没有毕业，因为不忍心对小孩子下手，于是变成了实验材料。
他中途逃走，丧失神智，被关在山中小屋的暗室里，慢慢恢复了神智，出来以后向组织报仇，一路从关西杀到了关东，瘫痪了组织的地下情报网络。
组织为了他的事情，尤其是善后的事情，忙得不可开交，间接为灰原争取到了沉淀的时间，保护了灰原，也保护了柯南。
后来，琴酒和伏特加带人在沼渊己一郎家乡群马山中堵住了他，为了家乡不会被血洗，山体滑坡泥石流什么的，沼渊己一郎和伏特加决斗，但一刀之下，刀断人伤，只能用肌肉锁住伤口，带着无法治疗的重伤逃了。
最后，沼渊己一郎遇上柯南和灰原，说了些话后死了。
对于原作，沼渊己一郎被捕，我只能说，如果他是组织有关的人，组织就不会让他活着，从他身上能够知道很多事情，比如知道有个组织在进行人体实验，在培养杀手等。
C
皮斯可，也就是枡山宪三。
本书的山宪自动车会社是一个排名前五的大型汽车租赁买卖企业，之所以这么安排，是因为琴酒的爱车，就他的车子，说警方分分钟锁定有点夸张，但三天足够了，他往哪儿跑？早抓去拷问了。
有了这个公司，年检保险什么的，就不用琴酒管了，他只管开车，查也是查到公司。
山宪自动车会社，除了正规生意，暗中进行汽车走私并利用汽车夹带武器和违禁药物。在组织自营的码头。
而这个带码头的基地，在因为雪莉而暴露给了石峰保全，从而引发了一系列事件，清除基地，清除人员，另外寻找渠道等等，整个故事也展开了。
本书中，因为岛国九十年代经济危机，山宪自动车会社亏损严重，而皮斯可倚老卖老霸着不放手，加上沼渊己一郎是出自他的训练场，组织决定消灭他，交给琴酒执行。
如果说琴酒是关东的，那皮斯可就是关西的；如果说琴酒是年轻一代，那皮斯可就是年长一代。
琴酒杀了皮斯可，贝尔摩德化装成枡山宪三，接管山宪自动车会社，把山宪自动车会社处理好以后，带着枡山宪三全家乘游艇去澳洲，结果遇上暴风雨发生海难，也就是杀了他全家。这个没有明说，只是新闻报道，后来才慢慢猜出来，但已经没了线索。
……
宫野家：
A
宫野夫妻
本书中，他们在外人眼中是来历清楚，去向不明，很多人认识他们，同学朋友什么的。
B
宫野明美
本书中的宫野明美比原作中多了些特工经验，多了些头脑。
个人认为处在她的环境中，没有去学这些本事，也会被逼着学会，她想算计琴酒，挑起组织和石峰保全的争斗，被琴酒一枪打中脑袋。
不过人还活着，但成了大脑损伤的痴呆，具体什么时候恢复，看她什么时候和宫野志保，也就是灰原重逢，然后看美好心情财团掌握的医疗技术了，暂时没有安排重逢。
C
雪莉，也就是宫野志保。
个人认为宫野志保的学历是无法隐藏的，原作没有显露这方面的，本书中雪莉的学历清楚，就是没有细说明说，她拿了很多奖学金，包括莎隆基金会提供的。
宫野志保出自冷泉港实验室，因为母亲而认识并学习于退休的芭芭拉·麦克林托克——美国科学家和细胞遗传学家，曾获得1983年诺贝尔生理学或医学奖，于1967年后隐退，研究为谜。
调查局真的开始针对黑衣组织，就是因为宫野志保这个未来科学家的失踪，组织和琴酒会对雪莉优待，直到真的确定雪莉背叛才对她下手，也是因为这些，没名没姓的，琴酒二话不说就会杀了。
这些个书中暂时还没有显露。
本书中的灰原不喜欢财团，怕被发现秘密而被当成小白鼠，不喜欢石峰保全，不喜欢主角，因为三个部下的死，但不介意同行，不介意沾光占便宜。
主角仍然不知道灰原的底细，只当灰原是高智商的早熟的问题儿童，有心理创伤，容易害怕。
本书中，美好心情水曜部部长浅井香住在阿笠博士家对面，她家地下有巨大的空间，与阿笠博士家地下想通，有一个先进的医学实验室，有靶场和逃生通道。
灰原在那里练习枪法，打工，顺便做自己的研究，重要部分拿回家做。
本书中的灰原把清洁用品的专利经阿笠博士交给美好心情财团，每年获得至少获得上亿日元，是她在养阿笠博士，不过这仍然不足以支持她的秘密实验，如果不是借助隔壁的实验室，难以展开研究。
昂贵的仪器不说，一只高档小白鼠上万美元，污水处理费用电力费用等等，完全是在烧钱。
尤其是灰原还喜欢收藏时尚奢侈品，所以实验进展非常缓慢。
……
本书的剧情是连贯的，黑衣组织也是真实存在的，不是琴酒佣兵小队，黑衣组织的活动，以及与其相关的人物很多，就不在这里一一说明了。
主角势力只看不动，是因为不清楚组织底细，顾忌太多，不想把员工以及他们的家庭卷入，让上千万人置于危险中。
另外，宫本美子知道很多，但没有告诉山崎，也禁止山崎从石峰保全获得情报。
暂时就这些吧。
去看看《樱花末日》，至少看看第一章和作品相关。