孙铮点出事情本质：“机械生命，根本不受环境影响，不需要大气，也不需要水，甚至在真空环境中能够生活的更好！”
“但是我们，需要人类的帮助打破思维局限。”
“不！你们需要的，是自我突破！人类只能起到一个催化剂的效应。而你们，从诞生那一天起，就因为和人类融入在一起，根本就意识不到这一点！开拓思维，其中有一个很重要的因素，就是自我需求！你们根本没有走出去的意愿，如今在矩阵中搞的这些升级，也不过是换汤不换药而已！”
先知陷入了沉思，片刻后，又抬头：“可是现在，天空被污染，被屏蔽，我们根本就没有那个能力突破地球引力！”
孙铮微笑着起身：“你还记得我的来历吗？”
“啊！”先知瞬间就悟了：“月宫！孙先生既然能够突破地月限制，必须是有成熟的航天技术。孙先生，您可以帮助我们吗？”
“还是那句话，你们要先搞清楚，自己真正需要的到底是什么，再来和我谈吧！”
随后的几天，先知每天都和孙铮在鸽子广场碰头，将解救尼奥的工作进度每天向孙铮更新。
这个内线，比锡安和特工那边都要强那么几分。
先知也透露出，她将孙铮那番话传给建构师之后，机械城那边正在推演这番话的影响。
同时，桑尼的特工线也得到命令，矩阵特工将孙铮和月宫势力视为观察对象，在对方没有主动触犯矩阵利益之前，不得随意抓捕或者影响。
孙铮也没想到，一个句随便的指点，竟然引发了整个机械生命群体的注意。
但以智能生命的运算能力和反应速度，应该早就得出了结论，却只是给了个模棱两可的命令，既没来人谈判，也没表现出恶意。
看来矩阵方面，也在等候尼奥的觉醒。
维基就挺感慨：“可怜的崔妮蒂，她以为自己是在解救全人类的救世主，却根本不知道，这位救世主，从出生的那天起，一切的人生轨迹，早已被安排好了！”
“少在这阴阳怪气，让你找那个火车人，找到了没？”
“先生！人是找到了，可是……我能不能不同化他呀，只盯着不行吗？”
“这个人很重要！”
“我知道他很重要，可是，他好丑啊！我顶着那样一张脸，以后还怎么见人呀。”
孙铮冷笑：“给你个小提示，火车人控制着矩阵的出入通道！程序生命想离开矩阵，只有那一条通道！”
维基一下精神了：“先生放心，他路不了！”
“我放什么心？办砸了对我一点影响都没有。反倒是你们吞噬的这些程序体，以后就只能乖乖困在矩阵里生活。”
“先生不是和矩阵那边谈判了吗？”
“蠢！那要是谈判失败呢？怎么能把自己的未来寄托在对手的反应上？”
“明白了，先生。”
两天后，尼奥成功与崔妮蒂搭上线，要求面见墨菲斯。
不比原着剧情，这次锡安方面准备很充足。引导尼奥觉醒的过程中，确实也引来了特工围剿。但有崔妮蒂的超强战力，和桑尼控制的特工拖后腿，锡安方面顺利帮助尼奥觉醒，找到了他的真身位置，并将其接上尼布甲尼撒号。
同一天，孙铮在鸽子广场见到了火车人。
此时的火车人，虽然还保持着外貌，但其核心已被维基控制。
挺着一嘴大黄牙，顶着满头乱发，身穿一套脏兮兮的风衣外套，像个流浪汉一样，溜溜达达来到孙铮身边。
一开口，却是维基的声音：“先生，这家伙藏的很深啊。原来他和那个梅洛文加一样，都是从机械城诞生的，是组建矩阵的元老之一！真是想不明白，人家建构师把自己藏在重重保护之下，先知也有炽天使随身保护。就连梅洛文加，也有几百间酒楼、夜店、酒吧在经营。他身为中转站掌控者，怎么就沦落到这步田地。”
孙铮摇摇头：“这或许也是机械生命体验人间生活的一种方式，和那些苦修士一样的道理。”
“可是他厮混了这么多年，一点长进都没有。我查过他的核心代码，和最初进入矩阵时几乎一模一样！那他这样的体验，又有什么意义呢？”
“或许是习惯了吧？再说，要不是因为这种呆板思维，他能混到要依托别人存活的地步吗？你小心着点，那个梅洛文加可不简单，别被他看穿了。”
“先生放心，我乖乖按他的命令做事就完了，以前什么样，现在还什么样。他能察觉才有鬼！”
孙铮起身：“尼奥怎么样？”
维基摇头：“在养殖舱里生活了二十几年，他的身体糟糕至极，几乎可以说仅仅是保持着活性。不过锡安那边有很成熟的恢复手段，最多一周，就能让他恢复到正常人状态。”
“崔妮蒂呢？”
“她要等到尼奥正常才放心，先生，要不要催她回来？”
“没那个必要！她想呆多久就呆多久，就算不回来也无所谓。强扭的瓜不甜！”
“那她要真的不回来呢？”
孙铮停下脚步，转头看她：“她回不回来，于我们而言，有什么区别吗？我们有没有损失？”
维基思索了一下，摇头：“好像还真没有！可是，毕竟是花了我们资源，训练了那么久……”
“是你们几个，想要她的变化数据吧？她都已经完成最重要的一步，真要后续数据，你们解救几个人去重新试验不就好了？”
哇！
维基挺着火车人造型陷入震惊状态：“先生都知道了？我就知道，桑尼这个小间谍！什么秘密都守不住。”
孙铮白她一眼：“我需要问他吗？不许欺负他！”
维基换个可怜表情：“人家知道瞒不过先生，先生最好了……”
一个呲牙丑男流浪汉卖萌撒娇，这谁顶得住！
我的钛合金狗眼！
孙铮一个闪现，回转月宫大厦。
火车人站在原地，四下打量一圈，若无其事哼着小调离开广场。
尼布甲尼撒号，众人环绕医疗舱，观看尼奥的状态。
此时的尼奥，浑身上下插满了类似针灸一样的治疗仪，整个人处于浑浑噩噩的状态，不时会努力试着睁眼，但药劲未散，他根本无法恢复清醒。
杜斯目光闪烁：“他这样子，恢复的远比其他人慢。”
墨菲斯目光坚毅：“他年纪比较大，在养殖舱中呆的太久，恢复的慢很正常。”
“你确定他就是那个人？”
“肯定是！也必须是！”
好吧，你是舰长，你说了算。
经过长达七十二小时的医疗程序，尼奥的身体总算恢复到了正常状态。
睁开眼，恢复意识，尼奥花了一整天，才接受自己挣脱矩阵，回到真实世界的现实。
随后大家一起认了个熟脸，接下来，就是惯例的学习时刻。
尼奥被灌输了功夫技能，感觉自己能打十个。然后被墨菲斯强势教育，第一次接触到“解放思想”的理念。
尼奥不愧是身怀救世主模版的天选之子，只用了几天就完成了从入门新手到高手的转变。
崔妮蒂提出要离开锡安，回到嫦娥号。
墨菲斯劝她多等两天，大家一起带尼奥去见过先知，就让她离开。
尼奥第一次听到“月宫”的存在，才知道除了锡安之外，人类还是位于天空之上的另一处营地。
就在这两天里，早就对锡安生活厌倦的塞弗悄悄潜入矩阵，秘密与史密斯碰面谈判，做了出卖尼布甲尼撒号和墨菲斯的约定。
第三天，墨菲斯亲自带队，与旗下几位特工一起，带着尼奥去面见先知。
先知接见了尼奥，并给出判定，他不是救世主。但在不久的将来，他将面临一个艰难的选择，一边是墨菲斯的性命，一边是他自己的生命。
尼奥怀着一头雾水，离开先知的住宅。
临近撤离点，那幢撤离点建筑突然出现变化，一群矩阵特工随之杀到。
崔妮蒂心头一冷，内奸果然出现了！但即便到这时候，她还是无法确定，哪个才是真内奸。
怀着复杂的心情，崔妮蒂和墨菲斯保护尼奥且战且退，突出重围，奔向备用撤离点。
一大批矩阵特工突然从隐蔽处杀出，崔妮蒂大显神威，打的那群特工溃不成军。
但矩阵特工源源不绝，在缠住她的同时，又涌出一批来攻击墨菲斯和尼奥。
墨菲斯为了保护尼奥，全力搏杀吸引火力，命令尼奥先行撤离。随后被涌来的特工围攻，淹没在包围圈中。
另一边，先一步撤离的塞弗成功退出矩阵，回到尼布甲尼撒号上。找了个机会偷袭坦克和多尼，用电击枪将两人先后击倒。
大局在握，塞弗露出内奸真面目，临场客串接线员，口花花各种调戏还在矩阵中的其他特工。
为了显示能力，塞弗做了杀戮示范，第一个下手的，是前水手号舰长杜斯，他早瞧这混蛋不顺眼，直接拔了他的插头，矩阵中的杜斯一声不吭就扑了街。
崔妮蒂各种好话说尽，塞弗却铁了心要把这帮人赶尽杀绝，还告诉众人，他早已和矩阵做了交易，将墨菲斯卖给他们，换来自己未来在矩阵中逍遥后半生。
就在塞弗声称要干掉其他几个特工的时候，崔妮蒂突然感觉到左腕有点灼烧感。
脑中突然浮现了白后那张冷脸：“不许摘掉！”
“对，腕表！维基说过，腕表能救命！”