帝国内部一个人可能利用假肢和机械器官替代受损或损坏的身体部件，或者只是为了提高自己的能力。机械神教仿生学的改造内容包括：身体部位，大脑植入物，控制性武器以及其他部分的替代设备乃至整个身体的替换。帝国没有仿生技术的固定标准，其改造水平也是参差不齐-许多仿生学是拙劣的和低效的替代，而最好的改造能够达到完美的复制，甚至大幅提高原有肢体或器官的性能。
机械神教为帝国审判庭提供的仿生学较为复杂的，它们拥有可以扭转死亡或瘫痪的方式。
在大多数帝国卫队团，只有部分人员可以获得仿生设备。另一方面，有的帝国卫队团甚至可以让每一个士兵都接受改造，从而使军队战斗力得到极大的加强。此外，钢铁之手战团是机械改造技术的著名使用者，他们竭尽全力改造自己的肉体，使之机械化，以便消除肉体的弱点。事实上，在一些有资格使用帝国仿生学的组织机构，几乎所有人都有可能接受机械化改造。即使是一些富裕的帝国公民，只要有足够的钱，也可以接受机械化改造。
虽然大多数仿生机械零件都是稀松平常的身体器官的替代品，例如许多人使用的人造血管，人造神经末梢等（它们通常用于替代受损的身体部分），但是一般的机械仿生结构依旧拥有大大超越原有普通身体结构的特殊能力，其具体类别主要有以下几种：
仿生器官
富人或特权阶层是其主要消费者，机械化改造可以代替患病或年老的器官，因此提供了一个增加寿命的方法。几乎所有器官可以更换，甚至部分大脑也可以更换。最简单的是单纯的替代品，而更先进改造技术则可以在原有基础上增加一些功能或者使器官拥有超出其原有效果的能力（相当于器官能力增幅技术，可以让你一跳百丈高，轻功水上漂）。
仿生感官
帝国的这种技术是通过模仿感官能力，从而达到代替眼睛，耳朵，鼻子的某些部分的能力，甚至是触摸和品尝的效果。更先进的仿生感觉甚至可以产生共感觉的效果（看过CANAAN的都知道什么是共感觉吧，就是你可以听见颜色，看见气味，尝到声音）。
仿生眼可以增加主体的视觉频谱，使你能够看到热量，以及可以锁定视觉和抵抗闪光致盲的影响。机械眼武器也不是什么困难的技术（参考雅叔），改造听觉可以提高听力至超越正常水平的地步，使用者可以听到的生物呼吸，心脏跳动。
植入结构
植入物有各种形状和大小，例如为大脑植入防护设备和存储器。一些比较深奥的改造结构将在下面列出。机械神甫们是最为著名的植入结构使用者群体，他们的身体拥有更多的植入部分，他们设计了一些特殊的植入结构，这个列表并不详尽:
帕普西-辅助装置
心灵辅助装置能增加大脑的控制能力，它负责精神的一部分活动，它拥有控制比使用者的装置级别更低者的精神的能力（就是局长可以控制处长，处长又可以控制科长，以此类推，相当于尤里的精神控制，只不过是分级别的，级别越高，控制别人能力越强）
心灵脉冲单元
心灵冲动单元是生命体的大脑和一台设备的神经联系，使个人，控制和监测系统的行动达到协调一致。这种技术最常用到的地方是无畏机甲和机械神教巨大的泰坦。在其他地方，它的主要用途是在手臂上安装武器，而最实际的应用之一，是允许使用者安装武器的同时保持双手可以自由活动。在一些无法安装武器的特殊情况下，为了设备能正常运作，它能让使用者在身体内部控制这些武器，提高武器的可操控性，使用者必须非常小心，以防止烧坏自己的大脑。心灵遥控设备也是存在的，虽然它很罕见，它通常用于控制机械设备或某些类型的仆人，这种技术可以解决一些棘手的问题，例如使用者无法完成某些工作时（可能是因为工作地点人类难以适应或者该地点太过庞大等），这种技术就被派上了用场，。
植入武器
植入武器是将现有肢体移除，拆卸掉手或整个手臂（拆掉整个手臂的情况比较少），用一个比一个更复杂的设备替代之。它可以提高武器的操纵性，但是大大削弱了手或手臂除移植部分外其他的战斗功能（例如你把手改造成一支电浆枪，就没办法再用链锯剑了）。因此，这种仿生不是特别实用，通常是为了起到恐吓的目的，这种技术的使用者接受的移植手术往往非常粗糙，通常会留下可怕的缝合疤痕，植入物也是超出自身身体素质所能承受的范围。另一个在身体上植入武器的原因是原先的先天条件不足，使用者需要担负某些特定职责，所以不得不在体内植入武器，例如角斗士（40K版斯巴达克斯，安格郎）和战斗奴工
Mechadendrites
Mechadendrites由机械神教用于帮助制造和建设，维护他们的机械卷须和辅助研究。这些机械改造被用于在其武器和身体装甲上，它几乎是他们自己的生命小型电机和驱动器。
电路网（Electoos）
电路网是利用金属条引导电能的特殊植入结构，它的使用数量有限;一个极端的例子是著名的电牧师，他们依靠自己劈啪作响的高压电弧进行战斗，电路网的使用者能够直接吸收设备或电源供电，然后驾驭利用这些电能，有时会造成灾难性后果。
反向思维
甚至在一些激进派系中间，它也被认为是极端措施。通过将创意，情绪，不合逻辑的大脑右半球摘除，然后用充满逻辑的左脑取而代之，接受这项改造的人，将是一位绝对理性的人。